Technik

Spezielle Suchmaschinen Vergleich genetischer Daten

Die Gesellschaft für Biotechnologische Forschung (GBF) betreibt im Internet eine öffentliche Gen-Suchmaschine. Mit ihr können Wissenschaftler Informationen über bestimmte genetische Sequenzen ermitteln. Die Suchmaschine NGFN-BLAST (Nationales Genomforschungszentrum - Basic Local Alignment Search Tool) erlaubt den Sequenzvergleich von speziellen ausgewählten Untergruppen wie etwa Mensch, Maus oder Ratte.

Der NGFN-BLAST-Server greift dabei auf die Daten von drei öffentlichen Gendatenbanken zurück, deren Inhalte in den USA, Großbritannien und Japan gesammelt und abgeglichen werden. Die neue Maschine aktualisiert diese Daten täglich, prüft sie auf Unstimmigkeiten und sortiert sie gemäß der gewünschten Untergruppen. Gibt man etwa die Gensequenz AAAACCTTAAGAAATATTTT" ein und startet dann eine eingeschränkte Suche nach ähnlichen Genabschnitten in Mensch, Maus und Ratte, zeigt die Suchmaschine an, dass es sich bei der Information um einen Teil des gamma-Interferon-Gens handelt.

Interferone spielen eine wichtige Rolle im Immunsystem. Sie können bestimmte weiße Blutkörperchen so aktivieren, dass sie Bakterien zerstören. Eingesetzt werden sie bei bestimmten Virus-Erkrankungen wie etwa Hepatitis. Die Suchmaschine NGFN-BLAST zeigt außerdem an, welche Interferone durch Patente geschützt sind und sind damit für die wirtschaftliche Nutzung genetischer Daten von Bedeutung.

Quelle: ntv.de

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